Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms