Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GGA3Q9NZ52 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms