Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms