Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY46

SCN3A, Sodium channel protein type 3 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN3AQ9NY46 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN3AQ9NY46 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN3AQ9NY46 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN3AQ9NY46 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN3AQ9NY46 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN3AQ9NY46 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN3AQ9NY46 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN3AQ9NY46 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN3AQ9NY46 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN3AQ9NY46 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN3AQ9NY46 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN3AQ9NY46 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN3AQ9NY46 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN3AQ9NY46 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN3AQ9NY46 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN3AQ9NY46 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN3AQ9NY46 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN3AQ9NY46 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN3AQ9NY46 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN3AQ9NY46 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN3AQ9NY46 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN3AQ9NY46 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN3AQ9NY46 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN3AQ9NY46 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN3AQ9NY46 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN3AQ9NY46 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN3AQ9NY46 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN3AQ9NY46 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN3AQ9NY46 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN3AQ9NY46 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN3AQ9NY46 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN3AQ9NY46 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN3AQ9NY46 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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