Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms