Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR1

CYTL1, Cytokine-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTL1Q9NRR1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms