Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms