Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms