Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms