Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TNRC6CQ9HCJ0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNRC6CQ9HCJ0 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNRC6CQ9HCJ0 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNRC6CQ9HCJ0 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNRC6CQ9HCJ0 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TNRC6CQ9HCJ0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNRC6CQ9HCJ0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNRC6CQ9HCJ0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNRC6CQ9HCJ0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNRC6CQ9HCJ0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNRC6CQ9HCJ0 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNRC6CQ9HCJ0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNRC6CQ9HCJ0 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNRC6CQ9HCJ0 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNRC6CQ9HCJ0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNRC6CQ9HCJ0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TNRC6CQ9HCJ0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNRC6CQ9HCJ0 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNRC6CQ9HCJ0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNRC6CQ9HCJ0 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNRC6CQ9HCJ0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNRC6CQ9HCJ0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNRC6CQ9HCJ0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNRC6CQ9HCJ0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNRC6CQ9HCJ0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNRC6CQ9HCJ0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNRC6CQ9HCJ0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNRC6CQ9HCJ0 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNRC6CQ9HCJ0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNRC6CQ9HCJ0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNRC6CQ9HCJ0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNRC6CQ9HCJ0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNRC6CQ9HCJ0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNRC6CQ9HCJ0 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNRC6CQ9HCJ0 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNRC6CQ9HCJ0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TNRC6CQ9HCJ0 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNRC6CQ9HCJ0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNRC6CQ9HCJ0 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNRC6CQ9HCJ0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNRC6CQ9HCJ0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNRC6CQ9HCJ0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNRC6CQ9HCJ0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNRC6CQ9HCJ0 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNRC6CQ9HCJ0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNRC6CQ9HCJ0 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TNRC6CQ9HCJ0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNRC6CQ9HCJ0 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TNRC6CQ9HCJ0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNRC6CQ9HCJ0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNRC6CQ9HCJ0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNRC6CQ9HCJ0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNRC6CQ9HCJ0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNRC6CQ9HCJ0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNRC6CQ9HCJ0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNRC6CQ9HCJ0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNRC6CQ9HCJ0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNRC6CQ9HCJ0 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TNRC6CQ9HCJ0 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNRC6CQ9HCJ0 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNRC6CQ9HCJ0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TNRC6CQ9HCJ0 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNRC6CQ9HCJ0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNRC6CQ9HCJ0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNRC6CQ9HCJ0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNRC6CQ9HCJ0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNRC6CQ9HCJ0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNRC6CQ9HCJ0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNRC6CQ9HCJ0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNRC6CQ9HCJ0 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNRC6CQ9HCJ0 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNRC6CQ9HCJ0 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNRC6CQ9HCJ0 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TNRC6CQ9HCJ0 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNRC6CQ9HCJ0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNRC6CQ9HCJ0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNRC6CQ9HCJ0 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TNRC6CQ9HCJ0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNRC6CQ9HCJ0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNRC6CQ9HCJ0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNRC6CQ9HCJ0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNRC6CQ9HCJ0 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNRC6CQ9HCJ0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TNRC6CQ9HCJ0 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TNRC6CQ9HCJ0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNRC6CQ9HCJ0 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNRC6CQ9HCJ0 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNRC6CQ9HCJ0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNRC6CQ9HCJ0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNRC6CQ9HCJ0 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNRC6CQ9HCJ0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNRC6CQ9HCJ0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNRC6CQ9HCJ0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNRC6CQ9HCJ0 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNRC6CQ9HCJ0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNRC6CQ9HCJ0 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNRC6CQ9HCJ0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNRC6CQ9HCJ0 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms