Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMURF2Q9HAU4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMURF2Q9HAU4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMURF2Q9HAU4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMURF2Q9HAU4 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMURF2Q9HAU4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMURF2Q9HAU4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMURF2Q9HAU4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMURF2Q9HAU4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMURF2Q9HAU4 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMURF2Q9HAU4 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMURF2Q9HAU4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMURF2Q9HAU4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMURF2Q9HAU4 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMURF2Q9HAU4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMURF2Q9HAU4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMURF2Q9HAU4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMURF2Q9HAU4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMURF2Q9HAU4 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMURF2Q9HAU4 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMURF2Q9HAU4 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMURF2Q9HAU4 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMURF2Q9HAU4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMURF2Q9HAU4 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMURF2Q9HAU4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMURF2Q9HAU4 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMURF2Q9HAU4 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMURF2Q9HAU4 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMURF2Q9HAU4 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMURF2Q9HAU4 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMURF2Q9HAU4 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMURF2Q9HAU4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMURF2Q9HAU4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMURF2Q9HAU4 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMURF2Q9HAU4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMURF2Q9HAU4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMURF2Q9HAU4 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMURF2Q9HAU4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMURF2Q9HAU4 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMURF2Q9HAU4 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMURF2Q9HAU4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMURF2Q9HAU4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMURF2Q9HAU4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMURF2Q9HAU4 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMURF2Q9HAU4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMURF2Q9HAU4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMURF2Q9HAU4 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMURF2Q9HAU4 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMURF2Q9HAU4 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMURF2Q9HAU4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMURF2Q9HAU4 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMURF2Q9HAU4 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMURF2Q9HAU4 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMURF2Q9HAU4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMURF2Q9HAU4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMURF2Q9HAU4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMURF2Q9HAU4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMURF2Q9HAU4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMURF2Q9HAU4 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMURF2Q9HAU4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMURF2Q9HAU4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMURF2Q9HAU4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMURF2Q9HAU4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMURF2Q9HAU4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMURF2Q9HAU4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMURF2Q9HAU4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMURF2Q9HAU4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMURF2Q9HAU4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMURF2Q9HAU4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMURF2Q9HAU4 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMURF2Q9HAU4 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMURF2Q9HAU4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMURF2Q9HAU4 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMURF2Q9HAU4 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMURF2Q9HAU4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMURF2Q9HAU4 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMURF2Q9HAU4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMURF2Q9HAU4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMURF2Q9HAU4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMURF2Q9HAU4 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMURF2Q9HAU4 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMURF2Q9HAU4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMURF2Q9HAU4 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMURF2Q9HAU4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMURF2Q9HAU4 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMURF2Q9HAU4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMURF2Q9HAU4 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMURF2Q9HAU4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMURF2Q9HAU4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMURF2Q9HAU4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMURF2Q9HAU4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMURF2Q9HAU4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMURF2Q9HAU4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMURF2Q9HAU4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMURF2Q9HAU4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMURF2Q9HAU4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SMURF2Q9HAU4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMURF2Q9HAU4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SMURF2Q9HAU4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SMURF2Q9HAU4 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms