Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms