Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F5

CCDC86, Coiled-coil domain-containing protein 86, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC86Q9H6F5 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC86Q9H6F5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC86Q9H6F5 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC86Q9H6F5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC86Q9H6F5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC86Q9H6F5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC86Q9H6F5 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC86Q9H6F5 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC86Q9H6F5 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC86Q9H6F5 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC86Q9H6F5 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms