Protein–RNA interactions for Protein: Q9H444

CHMP4B, Charged multivesicular body protein 4b, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BQ9H444 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP4BQ9H444 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP4BQ9H444 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP4BQ9H444 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP4BQ9H444 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP4BQ9H444 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP4BQ9H444 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP4BQ9H444 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP4BQ9H444 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP4BQ9H444 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP4BQ9H444 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP4BQ9H444 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP4BQ9H444 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP4BQ9H444 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP4BQ9H444 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP4BQ9H444 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP4BQ9H444 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP4BQ9H444 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP4BQ9H444 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP4BQ9H444 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP4BQ9H444 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP4BQ9H444 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP4BQ9H444 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP4BQ9H444 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP4BQ9H444 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP4BQ9H444 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP4BQ9H444 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP4BQ9H444 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP4BQ9H444 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP4BQ9H444 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP4BQ9H444 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP4BQ9H444 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP4BQ9H444 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP4BQ9H444 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP4BQ9H444 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP4BQ9H444 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP4BQ9H444 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP4BQ9H444 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP4BQ9H444 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP4BQ9H444 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP4BQ9H444 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP4BQ9H444 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP4BQ9H444 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP4BQ9H444 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP4BQ9H444 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP4BQ9H444 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP4BQ9H444 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP4BQ9H444 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP4BQ9H444 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP4BQ9H444 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP4BQ9H444 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP4BQ9H444 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP4BQ9H444 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP4BQ9H444 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP4BQ9H444 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP4BQ9H444 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP4BQ9H444 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP4BQ9H444 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHMP4BQ9H444 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHMP4BQ9H444 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP4BQ9H444 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP4BQ9H444 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP4BQ9H444 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP4BQ9H444 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP4BQ9H444 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP4BQ9H444 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP4BQ9H444 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP4BQ9H444 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP4BQ9H444 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP4BQ9H444 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP4BQ9H444 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP4BQ9H444 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP4BQ9H444 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP4BQ9H444 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP4BQ9H444 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP4BQ9H444 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP4BQ9H444 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP4BQ9H444 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP4BQ9H444 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP4BQ9H444 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP4BQ9H444 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP4BQ9H444 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP4BQ9H444 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP4BQ9H444 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP4BQ9H444 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP4BQ9H444 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP4BQ9H444 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP4BQ9H444 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP4BQ9H444 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP4BQ9H444 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP4BQ9H444 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP4BQ9H444 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP4BQ9H444 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP4BQ9H444 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP4BQ9H444 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP4BQ9H444 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP4BQ9H444 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP4BQ9H444 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP4BQ9H444 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP4BQ9H444 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms