Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1E5

TMX4, Thioredoxin-related transmembrane protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX4Q9H1E5 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMX4Q9H1E5 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMX4Q9H1E5 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMX4Q9H1E5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMX4Q9H1E5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMX4Q9H1E5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMX4Q9H1E5 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMX4Q9H1E5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMX4Q9H1E5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMX4Q9H1E5 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMX4Q9H1E5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMX4Q9H1E5 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMX4Q9H1E5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMX4Q9H1E5 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMX4Q9H1E5 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMX4Q9H1E5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMX4Q9H1E5 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMX4Q9H1E5 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMX4Q9H1E5 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMX4Q9H1E5 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMX4Q9H1E5 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMX4Q9H1E5 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMX4Q9H1E5 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TMX4Q9H1E5 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMX4Q9H1E5 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMX4Q9H1E5 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TMX4Q9H1E5 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMX4Q9H1E5 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMX4Q9H1E5 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TMX4Q9H1E5 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMX4Q9H1E5 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMX4Q9H1E5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMX4Q9H1E5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMX4Q9H1E5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMX4Q9H1E5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMX4Q9H1E5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMX4Q9H1E5 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms