Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms