Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms