Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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