Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms