Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D4

ZNF518B, Zinc finger protein 518B, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF518BQ9C0D4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF518BQ9C0D4 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms