Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms