Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms