Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC94Q9BW85 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC94Q9BW85 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC94Q9BW85 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC94Q9BW85 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC94Q9BW85 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC94Q9BW85 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC94Q9BW85 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC94Q9BW85 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC94Q9BW85 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC94Q9BW85 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC94Q9BW85 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC94Q9BW85 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC94Q9BW85 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC94Q9BW85 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC94Q9BW85 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC94Q9BW85 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC94Q9BW85 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC94Q9BW85 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC94Q9BW85 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC94Q9BW85 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC94Q9BW85 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC94Q9BW85 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC94Q9BW85 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC94Q9BW85 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC94Q9BW85 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC94Q9BW85 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC94Q9BW85 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC94Q9BW85 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC94Q9BW85 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC94Q9BW85 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC94Q9BW85 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC94Q9BW85 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC94Q9BW85 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC94Q9BW85 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC94Q9BW85 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC94Q9BW85 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC94Q9BW85 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC94Q9BW85 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC94Q9BW85 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC94Q9BW85 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC94Q9BW85 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC94Q9BW85 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC94Q9BW85 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC94Q9BW85 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC94Q9BW85 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC94Q9BW85 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC94Q9BW85 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC94Q9BW85 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC94Q9BW85 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC94Q9BW85 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC94Q9BW85 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC94Q9BW85 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC94Q9BW85 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC94Q9BW85 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC94Q9BW85 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC94Q9BW85 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC94Q9BW85 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC94Q9BW85 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC94Q9BW85 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms