Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE5

AGMAT, Agmatinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGMATQ9BSE5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGMATQ9BSE5 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGMATQ9BSE5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGMATQ9BSE5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGMATQ9BSE5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGMATQ9BSE5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGMATQ9BSE5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGMATQ9BSE5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AGMATQ9BSE5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGMATQ9BSE5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGMATQ9BSE5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AGMATQ9BSE5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGMATQ9BSE5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGMATQ9BSE5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGMATQ9BSE5 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGMATQ9BSE5 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGMATQ9BSE5 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGMATQ9BSE5 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGMATQ9BSE5 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGMATQ9BSE5 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGMATQ9BSE5 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGMATQ9BSE5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGMATQ9BSE5 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGMATQ9BSE5 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGMATQ9BSE5 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGMATQ9BSE5 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGMATQ9BSE5 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGMATQ9BSE5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGMATQ9BSE5 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGMATQ9BSE5 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AGMATQ9BSE5 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AGMATQ9BSE5 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AGMATQ9BSE5 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AGMATQ9BSE5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AGMATQ9BSE5 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AGMATQ9BSE5 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AGMATQ9BSE5 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AGMATQ9BSE5 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AGMATQ9BSE5 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AGMATQ9BSE5 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AGMATQ9BSE5 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AGMATQ9BSE5 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AGMATQ9BSE5 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AGMATQ9BSE5 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AGMATQ9BSE5 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AGMATQ9BSE5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AGMATQ9BSE5 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AGMATQ9BSE5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AGMATQ9BSE5 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AGMATQ9BSE5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AGMATQ9BSE5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
AGMATQ9BSE5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AGMATQ9BSE5 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AGMATQ9BSE5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AGMATQ9BSE5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AGMATQ9BSE5 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AGMATQ9BSE5 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AGMATQ9BSE5 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
AGMATQ9BSE5 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AGMATQ9BSE5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AGMATQ9BSE5 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AGMATQ9BSE5 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
AGMATQ9BSE5 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
AGMATQ9BSE5 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
AGMATQ9BSE5 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AGMATQ9BSE5 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AGMATQ9BSE5 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AGMATQ9BSE5 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AGMATQ9BSE5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AGMATQ9BSE5 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AGMATQ9BSE5 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AGMATQ9BSE5 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AGMATQ9BSE5 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AGMATQ9BSE5 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AGMATQ9BSE5 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AGMATQ9BSE5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AGMATQ9BSE5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AGMATQ9BSE5 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AGMATQ9BSE5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
AGMATQ9BSE5 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AGMATQ9BSE5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
AGMATQ9BSE5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AGMATQ9BSE5 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
AGMATQ9BSE5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AGMATQ9BSE5 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AGMATQ9BSE5 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AGMATQ9BSE5 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AGMATQ9BSE5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AGMATQ9BSE5 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AGMATQ9BSE5 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AGMATQ9BSE5 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AGMATQ9BSE5 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AGMATQ9BSE5 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AGMATQ9BSE5 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AGMATQ9BSE5 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AGMATQ9BSE5 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
AGMATQ9BSE5 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AGMATQ9BSE5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AGMATQ9BSE5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AGMATQ9BSE5 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms