Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms