Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms