Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LPIN3Q9BQK8 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms