Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms