Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms