Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms