Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms