Protein–RNA interactions for Protein: Q99590

SCAF11, Protein SCAF11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF11Q99590 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCAF11Q99590 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCAF11Q99590 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCAF11Q99590 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCAF11Q99590 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCAF11Q99590 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCAF11Q99590 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCAF11Q99590 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms