Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms