Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms