Protein–RNA interactions for Protein: Q96S99

PLEKHF1, Pleckstrin homology domain-containing family F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHF1Q96S99 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms