Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms