Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms