Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms