Protein–RNA interactions for Protein: Q96PL1

SCGB3A2, Secretoglobin family 3A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB3A2Q96PL1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCGB3A2Q96PL1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCGB3A2Q96PL1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCGB3A2Q96PL1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCGB3A2Q96PL1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCGB3A2Q96PL1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCGB3A2Q96PL1 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCGB3A2Q96PL1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCGB3A2Q96PL1 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCGB3A2Q96PL1 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCGB3A2Q96PL1 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCGB3A2Q96PL1 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCGB3A2Q96PL1 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCGB3A2Q96PL1 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCGB3A2Q96PL1 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCGB3A2Q96PL1 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCGB3A2Q96PL1 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCGB3A2Q96PL1 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCGB3A2Q96PL1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCGB3A2Q96PL1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCGB3A2Q96PL1 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCGB3A2Q96PL1 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCGB3A2Q96PL1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCGB3A2Q96PL1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCGB3A2Q96PL1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCGB3A2Q96PL1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms