Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms