Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms