Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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UBE2E2Q96LR5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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UBE2E2Q96LR5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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UBE2E2Q96LR5 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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