Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms