Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms