Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC9

EAF1, ELL-associated factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF1Q96JC9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms