Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms