Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms