Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms