Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms