Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMO7Q8WWI1 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMO7Q8WWI1 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMO7Q8WWI1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMO7Q8WWI1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMO7Q8WWI1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMO7Q8WWI1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMO7Q8WWI1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMO7Q8WWI1 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMO7Q8WWI1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMO7Q8WWI1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMO7Q8WWI1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMO7Q8WWI1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMO7Q8WWI1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMO7Q8WWI1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMO7Q8WWI1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LMO7Q8WWI1 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms